治疗胆囊癌药物包括化疗药物和中医药物。胆囊癌化疗药物对肿瘤具有直接的杀灭作用，效果较明显。而胆囊癌中医药物则具有副作用小、价格相对低廉、远期效果显著的特点。不同的胆囊癌患者，用药应有个体差异。
常见的胆囊癌化疗药物有氮芥、环磷酰胺、阿霉素、博莱霉素、长春新碱、平阳霉素、优福啶、哺氟啶等。此外，随着化疗的辅助用药的进步，通过在应用胆囊癌化疗药物后加用粒细胞集落刺激因子治疗，如吉粒芬、惠尔血、格拉诺赛特等，白细胞降低的副作用并不明显，而且还能允许化疗药物的剂量增加，使化疗疗效提高。
常见的胆囊癌中医药物有肝复乐胶囊、慈丹胶囊、金龙胶囊、珍香胶囊等，此类中医药物都是经过我国中医多年实践医学，研制而成的中成药物。胆囊癌中医药物在治疗中注重对患者全身脏器功能失调的调整，以提高机体的抗病能力为主要研究方向，没有明显的毒副作用。
随着新的胆囊癌药物不断被开发并用于临床试验，大大提高了胆囊癌药物治疗水平，为患者带来了更多新的希望。
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